Высокоточный генетический анализ на герминальные мутации врожденного характера в 6 разных генах, которые указывают на развитие туберозного склероза или нейрофиброматоза, а также ряда других патологий со схожей клинической картиной.

Показанием для проведения панели «Туберкулезный склероз и нейрофиброматоз» является необходимость установления герминальных мутаций врожденно характера в 6 разных генах, которые указывают на развитие туберозного склероза или нейрофиброматоза, а также ряда других патологий со схожей клинической картиной.

Для нейрофиброматоза первого типа характерна мутация в геноме NF1. Заболевание проявляется:

узелками Лиша, расположенными на радужной оболочке глаза;
множественными пятнами на коже, имеющими оттенок кофе с молоком, которые обычно локализованы в районе подмышечных впадин или паха;
нейрофибромами кожных покровов.

Почти у половины пациентов с таким диагнозом нервно-психологическое развитие может иметь некоторые особенности. Реже встречаются глиомы, поражающие зрительный нерв, искривление позвоночника, злокачественное поражение периферических нервов, васкулопатия, дисплазия большой берцовой кости. Даже у пациентов, являющихся близкими родственниками, клинические симптомы заболевания могут существенно отличаться. Практически каждый второй пациент с таким диагнозом унаследовал мутацию от своих родителей. Следовательно нейрофиброз 1 типа относится к распространенным наследственным патологиям. Частота его возникновения составляет 1 к 3 000.

Для нейрофиброза 2 типа характерна мутация в геноме NF2. Клинически патология проявляется образованием большого количества менингиом и шванном. Его характерным отличием считается развитие вестибулярных шваннов, что приводит к постоянному шуму в ушах или полной потере слуха. Кроме этого, у пациентов с нейрофиброзом 2 типа наблюдается развитие опухолей периферических, спинномозговых или черепных нервов, инстракраниальные или интраспинальные менингиомы, эпендиомы (злокачественные опухоли, поражающие центральную нервную систему). Не исключены офтальмологические нарушения, среди которых самыми распространенными становятся катаракты и существенное ухудшение зрения, вплоть до слепоты.

Что касается кожных покровов, то при нейрофиброматозе второго типа они намного тоньше, чем у пациентов с патологией первого типа. У большинства мутации носят наследственный характер, а у 1 из 3 диагностируют мозаичные генные изменения. Частота его возникновения составляет 1 на 60 000.

Существуют синдромы, имеющие схожую симптоматику:

синдром Легуса – проявляется формированием на коже многочисленных пятен оттенка кофе с молоком;
синдром LEOPARD – мультисистемная патология, провоцирующая поражение кожи, сердца, сосудов, скелета, с формированием коричневых пятен;
семейный шванноматоз – проявляется многочисленными периферическими, спинальными и черепными шваннами.

Туберозный склероз возникает в случае повреждения генов типа TSC1, TSC2. Это мультисистемная патология, для которой характерно поражение сетчатки глаз, внутренних ороанов, головного мозга узловидными опухолями гамартомами. Причиной развития заболевания является нарушение процесса развития плода в эмбриональном периоде. В случае поражения головного мозга у ребенка наблюдается умственная отсталость, приступы эпилепсии, аутизм или другие поведенческие расстройства. На кожных покровах появляются гипопигментированные пятна, разной локализации, оттенка. В почках могут формироваться многочисленные ангиомиолипомы. При повреждении гена TSC1 выраженность симптомов ниже.

Кровь берется не натощак, накануне исследования не употреблять тяжелую, жирную пищу.

Варианты, которые могут быть вероятной причиной заболевания, приоритизированы по проприетарному алгоритму с учетом рекомендаций ACMG, наличию в базах данных, популяционных частот и других критериев.

На основании проведенной приоритизации и фенотипа пациента, описанного в представленных документах, варианты сгруппированы по степени вероятности их патогенности для пациента. В группах варианты расположены в порядке снижения приоритетности. Варианты, не имеющие признаков патогенности, либо имеющие некоторые признаки патогенности, но не соответствующие фенотипу, описанному в сопроводительных документах, могут быть не включены в заключение.

Подробно с описанием исследования можно ознакомиться в приложении к заключению.

ВНИМАНИЕ! Варианты, обнаруженные в результате исследования, не являются установленным диагнозом, а могут быть использованы в совокупности с данными других лабораторных и инструментальных методов только врачом-генетиком. Для уточнения значимости обнаруженных вариантов, в том числе с учетом клинической картины пациента, необходима консультация врача-генетика. Также в заключении перечислен список исследуемых генов.

Исследование проводят:

детям, если на коже выявлено не менее 6 пятен оттенка кофе с молоком;
тем, у кого имеются признаки развития нейрофиброматоза;
тем, у кого имеются признаки развития туберозного склероза.

Анализ ДНК проводится по технологии секвенирования нового поколения методом парно-концевого чтения. Для пробоподготовки используется методика селективного захвата участков ДНК, относящихся к кодирующим областям генов с известным клиническим значением (клинический экзом) или генов, ассоциированных с группой заболеваний (панели генов) и описанных в курируемой базе данных ОMIM или специализированных курируемых базах.

Тестирование на наследственные мутации полезно в следующих ситуациях:

1. Семейная история рака:

- Наличие нескольких близких родственников, страдающих одним и тем же типом рака (например, рак молочной железы или яичников)

- Рак, диагностированный у нескольких поколений в одной семье

- Рак, диагностированный у родственников в молодом возрасте (например, до 50 лет).

2. Множественные виды рака у одного человека:

- Пациент, у которого диагностированы несколько различных типов рака (например, рак молочной железы и рак яичников).

3. Рак в молодом возрасте:

- Диагностика рака в возрасте моложе, чем это обычно ожидается для данного типа рака (например, рак молочной железы в возрасте до 40 лет).

Ограничения метода:

Среднее покрытие целевых участков секвенирования в исследуемых генах составляет не менее 70х. Это означает, что каждый исследуемый участок генома в среднем анализируется не менее 70 раз во избежание влияния технических ошибок чтения на результаты исследования. Такое покрытие позволяет осуществлять детекцию вариантов в среднем не менее чем в 98% целевых участков, входящих в исследование. Для сложных участков генома (например, GC-богатых участков) среднее покрытие может быть ниже. Участки генома с покрытием, не соответствующим критериям достоверности вследствие технических ограничений сиквенса, в дальнейший анализ не включаются.

Метод позволяет выявить наследуемые или вновь возникшие (de novo) варианты нуклеотидной последовательности (однонуклеотидные замены, небольшие инсерции и делеции – до 10 п.о.), которые могут являться причиной генетического заболевания.

Технические ограничения метода не позволяют выявлять инсерции и делеции длиной более 10 п.о., мутации в интронных областях (за исключением канонических сайтов сплайсинга), вариации длины повторов (в том числе экспансии триплетов), а также мутации в генах, у которых в геноме существует близкий по последовательности паралог (псевдоген). Метод не предназначен для определения фазы пар гетерозиготных мутаций, а также для оценки уровня метилирования или выявления мутаций в состоянии мозаицизма.

В некоторых случаях биоинформатический анализ данных позволяет заподозрить наличие структурных перестроек (микроделеций и микродупликаций). Однако этот подход не является рекомендованным методом анализа вариаций числа копий генов, и обнаруженные перестройки подлежат обязательному подтверждению референсным методом (хромосомный микроматричный анализ). Мелкие структурные нарушения, однородительские дисомии и мозаичные варианты числа копий генов методом секвенирования не выявляются; для этого должен быть использован валидированный метод хромосомного микроматричного анализа. Невыявление структурных вариантов при секвенировании не исключает их наличия у пациента.

Для проведения теста требуется 2-4 мл венозной крови в вакуумной пробирке с ЭДТА (фиолетовая крышка).

Клиент самостоятельно осуществляет забор биоматериала, используя набор расходных материалов, предоставленных нашей лабораторией, либо обращается в медицинскую организацию. Внимание! Вы самостоятельно обеспечиваете соблюдение инструкции по забору биоматериала. Срок сохранности биообразцов с момента забора 72 часа!

В случае обращения клиента к нашему партнеру он несет ответственность за действия или бездействие медицинской организации. Наши партнеры обеспечены необходимыми расходными материалами.

Также обратите внимание: если в лабораторию биоматериал поступил ненадлежащего качества (например, с нарушением условий хранения или транспортировки), это может увеличить срок выполнения анализа или сделать его проведение невозможным.

Мы НЕ храним биоматериал после оказания услуги.

В течение 1 рабочего дня после оформления услуги мы отправляем Вам набор расходных материалов: 1 пробирка с ЭДТА c фиолетовой крышкой, 1 гелевый хладоэлемент, один непроницаемый защитный пакет, один защитный конверт, одна коробка для транспортировки, документы (Инструкция по забору крови, Форма заказа и Согласие на обработку персональных данных).

За 1 рабочий день до планируемой даты забора биоматериала Вы сообщаете нам удобные дату, время и адрес (через мессенджер или иным согласованным способом). Мы подтверждаем детали и направляем курьера, которому необходимо передать готовый к транспортировке набор.

Если по каким-либо причинам Вы не смогли передать набор курьеру в указанные сроки, Вы можете отправить его самостоятельно на адрес лаборатории или связаться с персональным менеджером для выбора новой даты забора.

Если передачу биоматериала оформляет ваш представитель, он должен предъявить документы, подтверждающие полномочия.

Все расходные материалы, предоставленные в наборе, являются оборотной тарой и подлежат возврату — либо вместе с биоматериалом, либо при прекращении действия услуги.

Инструкция по забору и транспортировке крови